十六世纪前
中世纪
在非洲有一个名为「尼迪帕亚」的古老部落，据传说在其王国首都有着名为「太阳阶梯」的花朵，太阳阶梯具有非常强烈的毒性，吃下去的人几乎都会死亡。但是在很稀少的状况下会有能够抵抗这种毒性的强者出现。战胜这种毒性的人，能够得到超越人类的能力，并因而登上王座。
但是一次失误导致首都有大量人变异，这使得迪帕亚族的人放弃了王国首都，移居到一块沼泽地中，并将那块土地视为圣地，绝对不让外人知道圣地的秘密。尼迪帕亚族还规定每个壮年男性必须去守护圣地2年。（《生化危机5》）
位于「欧洲」的「西班牙」某地，「萨拉扎家族」创建了一个名为「光明教」的教，并开始在当地传教，但效果并不好。（《生化危机4》）
十六世纪
1554年
光明教的第七任教主「亚当·萨德勒」，在当地城堡附近挖掘出了一个化石，化石内一种不知名的寄生虫，亚当将其命名为「普拉卡」，随后亚当在此处发现了更多的普拉卡，其中有可以控制其它的普拉卡的「支配型普拉卡」，其余的则是「服从性普拉卡」，随后他利用普拉卡在进行秘密的宗教活动。（《生化危机4》）
十八世纪
约1700年
光明教的宗教活动越发猖狂，这件事也传到了当地领主「格雷戈里奥·萨拉扎」耳中，于是他带领一支军队杀死了大部分光明教教徒，并将普拉卡全部深埋，国王也封格雷戈里奥为伯爵，萨拉扎家族开始世代镇守普拉卡。
萨德勒家族带着部分服从性普拉卡和支配性普拉卡离开，并发誓日后一定要再回到这里。（《生化危机4》）
1741年
第二任城主「伊波利托」在位时期，光明教唤醒普拉卡寄生虫让其涌出城堡，但在伊波利托的顽强抵抗下，成功阻止了光明教的计谋，光明教时任教主「海斯特·萨德勒」带领众人去到附近海上的孤岛蛰伏起来。
第三任城主「格雷戈里奥二世」在位时期，为了防止伊波利托时期的悲剧，于是在城堡内大肆修建机关，并巩固城防，因为普拉卡寄生虫的弱点之一为水，于是格雷戈里奥二世在地下修建了一条水道，水道也被称为「格雷戈里奥水道」。（《生化危机4》）
十九世纪
1800年
大航海时代无数欧洲人组建商队前往非洲掠夺资源，欧洲富商「托马斯·特拉维斯」也顺势创立了「海上贸易集团」往返非洲，托马斯之子—「亨利·特拉维斯」投入了大量自己的资金到探索非洲上。他派遣了5支勘探队前往「非洲大陆」探寻每一个角落。
在第5次也是最后一次对非洲的探索之后，亨利将他的勘探记录整理成72册书的总集「《自然历史调查》」，这些书涵盖了从动物，植物，昆虫，矿物以及居民的居住地质环境和习俗，历史，传统。这些书还包括了非洲大陆上的各种民俗。这些书就是非洲大陆的百科全书。亨利的调查被出版了出来，但是他的一丝不苟的细节却被看做是他自己的想象和编造，这些书被科学界严重地怀疑作只是一个长篇故事，只出版了很少的数量，被科学界的拒绝令亨利深受打击，非常的沮丧。（《生化危机5》）
1861年
「西蒙斯家族」建立了一个组织—「家族」。
「阿克雷山区」附近成为「南北战争」中西部的主要战场。
1879年
「浣熊镇」建立。
1881年
浣熊镇被州政府正式登记。
「米兰达」在欧洲的「罗马尼亚」出生。
二十世纪
1909年
米兰达的孩子「伊娃」出生。
1918年
「西班牙流感」爆发。
1919年
西班牙流感导致米兰达的女儿伊娃丧生，绝望的米兰达冒险进入村庄附近的一个洞穴打算自杀。临自杀前发现一个巨大而古老的超级真菌菌落，她将其称之为霉菌。米兰达触摸了从霉菌中长出的一大块「真菌根（菌主）」，过程中，她看到了数百年来成百上千个被这种真菌吞噬的人的记忆，其中包括女儿伊娃的记忆也在里面。米兰达相信只要找到一个合适的寄主或许能复活死去的女儿，于是她秘密地利用无助的村民作为试验对象，希望能找到适合转变成伊娃的「容器」，于是她从霉菌中提炼出一种寄生体并命名为「“恩赐”」，并且将“恩赐”注射村民体内，这也因此治愈了村庄中的流感，并被当地人尊称为「母神米兰达」。
但这并没有让米兰达满意，于是她开始从附近抓小孩来接种“恩赐”，其中「阿契娜·蒂米特雷斯库」、「唐娜·贝内文托」、「塞尔瓦托·莫罗」以及「卡尔·海森伯格」这四位小孩在接种“恩赐”后并没有变成「狼人」一类的怪物，虽然莫罗形态类似怪物，但却保留了人类的智慧，可这依然没有让她找到好的容器，于是米兰达为了更快地找到容器，她封蒂米特雷斯库、贝内文托、莫罗以及海森伯格为当地的四大贵族，并委任他们对当地的村民进行着实验。
米兰达在此过程中还发现了一种可以消除被霉菌感染的人体内的霉菌，米兰达将其称之为「净化结晶」。（《生化危机8》）
1923年
「奥斯维尔·爱德华·斯宾塞」出生。
1945年
浣熊市被美国政府列入重点发展的试点。
斯宾塞在欧洲滑雪时，发生意外，但却被米兰达拯救，随后斯宾塞拜米兰达为师，但最终因为意识不同而分道扬镳。（《生化危机8》）
1958年
蒂米特雷斯库在米兰达的帮助下成功地使三个女孩变异，随后她为这三位女孩起名，长女「贝拉·蒂米特雷斯库」、二女「卡珊德拉·蒂米特雷斯库」、三女「丹妮拉·蒂米特雷斯库」，而她们也成为了蒂米特雷斯库夫人的三个女儿。（《生化危机8》）
1960年
「巴瑞·伯顿」、「杰克·贝克」出生。
一名电力工程师的「迈克尔·沃伦」来到浣熊市，这标志浣熊市进入“电气化”。
声名显赫的「亚希福特家族」第六代家主「爱德华·亚希福特」和斯宾塞在非洲「古尼迪帕亚遗迹」内的菊科植物太阳阶梯中发现一种古代病毒，病毒能使生物体基因变异，失去意识，并且拥有极强的生命力和抵抗力。鉴于这种病毒的奇异特征，两人决定研究这种病毒，并命名为「始祖病毒」，始祖病毒母体样本诞生。（《生化危机5》）
（具体时间未知）斯宾塞为「威斯克计划」选了11位新生儿，最后只有两位孩子在注射了始祖病毒后成功活了下来，于是斯宾塞分别为他们取名为「阿尔伯特·威斯克」和「亚丽克丝·威斯克」。（《生化危机5》）
1963年
由于研究病毒的需要，斯宾塞以未来公司主管的度假别墅为借口，聘请著名建筑师「乔治·特列博尔」在浣熊市的「阿克雷山区」建造了内部结构复杂，机关重重的「洋馆」。（《生化危机1》）
1967年
家族组织新任首领「德里克·C·西蒙斯」出生。
纽约成立了第一支「特别战术及营救小组」，英文缩写为「S.T.A.R.S.」，随后S.T.A.R.S.由前「国家安全保障与防卫厅」长官「马尔科·帕尔米埃利」领导，并在纽约成立「S.T.A.R.S.总部」，在马尔科·帕尔米埃利领导下，S.T.A.R.S.组织的影响力开始渐渐扩大，随后在美国各地区都设立分部。
洋馆完工后，斯宾塞随即邀请特列博尔一家前往洋馆度假。
特列博尔的妻子「杰西卡」与女儿「丽莎」进入洋馆，随即被植入始祖病毒变异株「Type-a型」与「Type-b型」。
11月13日特列博尔亦被挟持到洋馆遭到**。
11月16日，杰西卡与病毒融合失败遭到废弃处理，而丽莎却与病毒融合，但却失去理智，袭击供应饮食的女研究员，并剥下她的面皮。
11月27日，特列博尔从地下密室逃出，开始寻找出路。但他发现洋馆的结构和他当初设计的并不一样因此无法逃出，最终于11月30日在绝望中死去。（《生化危机1》）
1968年
「道格·赖特」出生。
爱德华·亚希福特，奥斯威尔·E·斯宾塞，「詹姆斯·马库斯」三人成立跨国制药企业安布雷拉公司。公司表面为财力雄厚，等级森严的制药公司，但在不为人知的背后却进行着病毒的研究和开发。由于找不到稳定病毒的方法，爱德华·亚希福特逐渐忽略打理公司业务，大权逐渐落到斯宾塞手中。
爱德华之子「亚历山大·亚希福特」建造了「南极研究所」，主要研究基因遗传。
1971年
「杰克·克劳萨」出生。
众多研究员敬仰的同时也是始祖病毒奠基者的爱德华·亚希福特感染病毒去世。其子亚历山大早已取得博士学位，成为了亚希福特家族第七代家主。
亚历山大提取了家族创始人亚希福特家族第一代家主「维罗妮卡·亚希福特」的基因，通过人工授精的方式制造出「阿尔弗雷德·亚希福特」和「阿莱克西亚·亚希福特」兄妹，寄希望于培养出智力超群的后代。（《生化危机：代号维罗妮卡》）
1972年
「比利·科恩」出生。
1973年
「克里斯·雷德菲尔德」出生。
1974年
「艾达·王」出生。
1975年
「吉尔·瓦伦蒂安」出生。
1976年
「路易斯·塞纳·纳瓦罗」出生，他从小就十分聪明，并且最喜欢「《堂吉诃德》」这本小说。
公司董事詹姆斯·马库斯出任浣熊市「阿克雷研究所」以及「新建干部养成所」的负责人。（《生化危机0》）
1977年
「卡洛斯·奥利维拉」、「里昂·斯科特·肯尼迪」出生。
9月19日干部养成所，新病毒的研究终于有了成效，在将病毒与「水蛭DNA」结合后达到了马库斯预期的突破，马库斯将其命名为「T病毒」。
为了完善病毒，马库斯决定放弃「啮齿类动物」作为研究对象，而改用「哺乳动物」，必要时就以人为实验对象。
11月15日，马库斯发现有人暗中调查他的研究，并猜到是斯宾塞所为。（《生化危机0》）
1978年
2月11日实验室入口遭到破坏，马库斯求助于他的得意门生「威廉·柏金」和威斯克，并且为了夺得主动权而在董事会上公布了T病毒。不料斯宾塞早有准备，并指示威廉和威斯克杀掉马库斯。
6月3日马库斯在研究病毒时被闯进来的特种部队开枪击毙。临死前马库斯看到了威廉和威斯克。马库斯的尸体被冲入下水道。然而「水蛭女王」的病毒附到他身上。（《生化危机0》）
7月31日威廉和威斯克前往阿克雷研究所担任主要研究员，两人接手“T”病毒的研究。（《生化危机1》）
1979年
克里斯的妹妹「克莱尔·雷德菲尔德」出生。
1980年
「瑞贝卡·钱博森」、「艾格莉·海尼根」出生。
1981年
「史蒂夫·伯恩塞德」出生。
「卡拉·拉达梅丝」出生。
7月27日年仅10岁的天才少女阿莱克茜亚从大学毕业。阿莱克茜亚被安布雷拉分配到南极研究所。由于阿莱克茜亚的存在，导致威廉·柏金几乎疯掉。在过去的3年中T病毒的研制基本完成，只有近10%的人能免疫，所有人都满足于此成果时，斯宾塞却命令继续研究，直到开发出能毁灭世界的生物兵器，几乎没人知道斯宾塞的目的。威廉受到巨大冲击，疯狂地使用浣熊市的市民进行试验。（《生化危机：代号维罗妮卡》）
1983年
2月17日阿莱克茜亚的哥哥阿尔弗雷德在南极研究所的密室中了解到自己与妹妹的身世，开始憎恨父亲亚历山大。
3月3日，阿莱克茜亚将始祖病毒与「蚁后基因」融合，制造出新型「T-维罗妮卡病毒」，并在阿尔弗雷德帮助下以自己的父亲亚历山大为实验体植入维罗尼卡病毒。
4月22日维罗妮卡病毒人体实验失败，亚历山大化为危险的怪物—「诺斯拉图」，随后被监禁于南极基地的地下牢房中。
为了彻底完善维罗妮卡病毒，阿莱克茜亚将维罗妮卡病毒植入自己体内，并以冰冻的方式延缓病毒变异造成的智力衰退，由此进入长达十余年的沉睡。
阿尔弗雷德回到「洛克福德岛」出任军事训练司令。不久他出现恋妹情节以及人格分裂症状，因此有关维罗妮卡病毒的研究全部终止。
12月31日从南极研究所传来阿莱克茜亚由于感染病毒而死亡的消息。至此，威廉的情绪才恢复正常，而威斯克开始考虑斯宾塞的真实想法，并欲脱离安布雷拉。（《生化危机：代号维罗妮卡》）
1984年
「伊森·温特斯」出生。
「阿什莉·格拉汉姆」出生。
第七任城主「迭戈·萨拉扎」的之子「拉蒙·萨拉扎」出生。
1986年
「谢娃·阿洛玛」在「马里」出生。
威廉和同事「亚妮·柏金」结婚，之后两人的女儿「雪莉·柏金」出生。（《生化危机2》）
一只莫名感染普拉卡的狼袭击了路易斯的祖父，普拉卡的幼虫也因此寄生了他，之后路易斯祖父的情况越来越严重，村民们认为他感染了几百年前村子里曾流行的“疯病”，而路易斯祖父也认识到自己命不久矣，于是他将路易斯托付给与他关系很好的村长—「比陶瑞斯·门德斯」，当村民们将路易斯的祖父带到一个木屋中并连屋带人一起烧掉。
第二天，路易斯为查明祖父死亡原因而离开了村子，门德斯和村民们寻找路易斯无果，于是他们将路易斯一家的房子留下，而路易斯和他祖父的照片则被门德斯珍藏起来。（《生化危机4》）
1987年
「皮尔斯·奈文斯」出生。
1988年
迈克尔出任浣熊市市长，并且与安布雷拉建立了紧密联系，半数市民都被安布雷拉雇佣。
此时，威廉已经是病毒研究的绝对权威，病毒的研究也进入成熟阶段。按照斯宾塞的构思，带有攻击意识的战斗生命体「暴君」被制造出来了。（《生化危机2》）
同年成立的法国安布雷拉分公司正在进行最新的「复仇女神计划」，这是一种全新思路的生化兵器。「复仇女神」是操纵基因而人工创造出来的寄生体，它寄生在寄生体的大脑，强化智能。所以如果把复仇女神与“T”病毒融合，就能培养出高智能的战斗生物。但是在复仇女神寄生后大多数生物都因为承受不了5分钟的智力支配就会死亡。所以最后还是只有借助第一个实验体丽莎，进入她大脑的复仇女神消失了。（《生化危机3》）
1989年
「海伦娜·哈伯」出生。
1990年
萨德勒家族的第十五任族长兼光明教新任教主—「奥斯穆德·萨德勒」乔装成四处游历的医生，以此被拉蒙的母亲「卡塔丽娜」请进城堡内，萨德勒开始对本就患有心理疾病的拉蒙进行蛊惑。（《生化危机4》）
1991年
巴瑞之子「莫伊拉·伯顿」出生。
威廉向公司提出了最新的「G病毒」，斯宾塞批准开发。丽莎被注射了始祖病毒，以至后来所有的病毒在她身体里都能融合并不断变异，甚至吸收了复仇女神。
威廉正是从丽莎身体中提取出了G病毒。G病毒的特性是使基因变异，导致宿主的身体结构和细胞结构全部发生改变，而威斯克早已不再关心病毒，他争取到前往浣熊市警局当卧底的机会，暂时脱离了安布雷拉。
苏维埃联邦解体后，原加盟国「东斯拉夫共和国」独立为主权国家。该国拥有富饶的黑土地域，养蜂业等农业项目也极具盛名。然而独立后没多久，由于天然资源的开发等大量项目，国民间出现了严重的贫富差距。受富裕人士支持的政府与贫困潦倒的民众间频现纷争，国内甚至出现了新的分离独立运动，史上第一位女总统「斯维特拉娜·贝利科娃」主动向独立派提出休战。（《生化危机：诅咒》）
原苏联上将「谢尔盖」为了振兴苏维埃，于是加入了安布雷拉，并且谢尔盖的体质可以完美地造出暴君，于是谢尔盖只得将自己的十位出生入死的克隆体兄弟送给了安布雷拉。
1992年
威斯克之子「杰克·穆斯」出生。
海伦娜的妹妹「黛博拉·哈珀」出生。
在安布雷拉的经济援助下，浣熊市开始大幅度重建和更新，发展迅速。
威廉的新研究所就建在了浣熊市的地下。
1993年
「水上浮城」—「泰拉格里吉亚」开始了建设。（《生化危机：启示录》）
克劳萨在美国「红色贝雷帽」服役。
7月，阿尔弗雷德从英国一所大学毕业，再次接手南极研究所，随后斯宾塞在洛克福特岛给了阿尔弗雷德担任军事主管和研究室主任的职位。
1994年
安布雷拉工厂的病毒意外泄露，谢娃的父母因此死亡，但安布雷拉却将此事掩盖，这引起了谢娃的强烈不满。
9月，阿尔弗雷德在南美洲的洛克佛德岛上建造了一所监狱和私人洋馆，这所监狱主要关押的都是与各国政府秘密签订协议、人口贩卖而来实验用的死刑犯。
路易斯凭借过人的天赋早早大学毕业，后被安布雷拉青睐，成为了安布雷拉内部团队—「欧洲梦之队」的一员，路易斯也在安布雷拉坚持研究几种非处方药的同时，还参与了复仇女神计划。
萨德勒利用仅剩的普拉卡杀死了第七任城主迭戈，拉蒙也在萨德勒的蛊惑下，开始招募村民挖掘城堡的地下。
1995年
7月31日，威斯克和威廉再次来到伴随他们成长的阿克雷研究所，由于丽莎在吸收了复仇女神后又开始撕其他女性的面皮，威斯克和威廉为了不使机密泄露而决定销毁丽莎。经过3天的生命停止反应后，丽莎被运到森林里的小木屋里，那里也放着丽莎的母亲杰西卡的棺材。（《生化危机1》）
经过长时间挖掘，大部分前往挖掘的村民感染了普拉卡幼虫的孢子，并变得狂躁，萨德勒也如愿得到了远古普拉卡寄生虫变成的「琥珀」。
萨德勒打算绑架了美国总统的女儿阿什莉，为了更好地控制阿什莉，萨德勒招募了许多研究员，而辞职返乡的路易斯也被招募其中，他和其他招募的研究员，将琥珀中的DNA提取并改良成了「良种普拉卡」，随后拉蒙注射了良种普拉卡，并由拉蒙开始在城堡中做普拉卡的实验，而萨德勒也注射了最后一个支配性普拉卡。
路易斯等研究员也因此被萨德勒注射了良种普拉卡。
萨德勒以治疗疾病的说辞说服了当地德高望重的村长门德斯和村民们，并为门德斯注射了良种普拉卡，其余的村民则注射了服从型普拉卡。
发现安布雷拉黑暗秘密的路易斯选择了离开，并回到了曾经的家乡试图以曾经的所学找出祖父得的病，回到家乡的路易斯发现成村子里的人很奇怪，但他并没有在意，随后经过门德斯的介绍，路易斯加入了萨德勒，开始研究普拉卡。
萨德勒招募了许多研究员和军事人员，并在曾经萨德勒家族被流放的孤岛上建立了军事基地以及研究所。（《生化危机4》）
1996年
一度面临解散的「S.T.A.R.S（特殊战术及救援特勤部队）」在浣熊市重组，由威斯克担任队长。
10月,「汉克」在洛克佛特岛上开始接受军事训练，训练的主要任务就是和各种被病毒感染的生物进行实战。
卡拉大学毕业。
1997年
合众国海军特种部队少尉比利和他的战友被错误派往一座村庄，在那里并没有所谓的游击队，但比利的战友还是将当地23名村民杀死，并把这件事嫁祸到比利头上。（《生化危机0》）
1998年
《生化危机0》《生化危机1》《生化危机：爆发1》《生化危机3：最后逃亡》《生化危机：爆发2》《生化危机2》《生化危机2DLC：第四生还者》《枪下游魂》《生化危机：代号维罗妮卡》剧情展开
马库斯博士的尸体在水蛭女王和T病毒双重影响下重生，以雌雄同体的水蛭人的身份恢复意识，并发誓报复安布雷拉。
5月11日，在马库斯的破坏下阿克雷研究所、干部养成所、地下研究所等地相继发生病毒泄漏事故，工作人员和实验生物相继被感染，阿克雷研究所新主任「约翰」死亡。
5月14日，浣熊市「废弃物处理工厂系统」完成，该系统利用特殊瓦斯，化学溶剂与焚化炉来分解各种生化兵器的细胞并销毁处理。
5月20日，阿克雷山区发生第一例生化怪物攻击人类事件。
数天后，浣熊市郊的阿克雷山区附近，连续发生离奇的杀人事件，不少民众在山区附近受到不知名生物的袭击，因而丧失性命。期间相继传出目击犬型怪物的事件。
5月21日，安布雷拉研究员发表最新医学论文，提及在阿克雷山区发现的三种同种异形草药，分别命名为「绿色草药」、「红色草药」、「蓝色草药」。
5月27日，浣熊市时报对于年轻女性被猛兽攻击致死之事件以头条加以报导。
6月初位于浣熊市公园内的秘密实验体销毁场因为研究所运来的尸体数急剧增长，而无法以正常方式处理尸体。
6月16日，大规模的生化怪物出没于山区。
6月30日瑞贝卡以实地医护人员的身份加入S.T.A.R.S.的「布拉瓦小队」。
7月9日警方封锁部分森林，并考虑派遣特别对策部队S.T.A.R.S.进入山区。
7月中旬实验体销毁工厂已无法处理数量巨大的尸体，工人们因此被迫暴露在病毒之下工作，部分员工开始呈现被感染症状，同时，安布雷拉公共卫生部常务理事接到总部特别委员会的灾害传真，委员会认为浣熊地区病毒泄露事故可能已经无法控制，该委员会决定严守秘密实验，并防止S.T.A.R.S.，布拉瓦小组和州警介入。
7月22日，合众国海军特种部队少尉比利因被指控在一次非洲执行任务过程中枪杀23人，而被军事法庭判处死刑，经由阿克雷山区押送至「lexson基地」执行。
数小时后，押送车辆在阿克雷山区遭受不明怪物攻击，押送人员死亡，比利下落不明。
为了避免机密外泄，因此安布雷拉隐藏了情报，企图私下解决此一事件，同时为了进行「B.O.W」的实战能力测验，便透过安布雷拉干部威斯克的安排，引诱S.T.A.R.S.部队进入灾害地区。
7月23日，马库斯博士的复仇计划开始。
当日20点，马库斯指挥水蛭袭击了安布雷拉途经阿克雷山区的列车，此事件被称为「黄道列车事件」。
2小时后浣熊市警局特殊部队S.T.A.R.S.的布拉瓦小队，乘坐直升机出动前往阿克雷山区进行调查。
布拉瓦小队中的成员瑞贝卡遇见了逃犯比利，后来他们俩人联手，并且在寻找幕后黑手的过程中，比利告诉瑞贝卡有关他的冤情和所谓“枪杀23名平民”的真相，最终二人摧毁了马库斯的计划，马库斯连同「马库斯宅」和地下实验室一起被摧毁，随后比利和瑞贝卡分道扬镳，瑞贝卡前往了洋馆。
7月24日，S.T.A.R.S.的布拉瓦小队失去联络已达24小时，威斯克以支援布拉瓦小队为由，率领阿尔法小队进入阿克雷山区计划通过阿尔法小队的实战收集各种b.o.w数据。
抵达地点后，阿尔法小队被山区里受到感染的丧尸犬袭击，不得不逃进附近的洋馆里，并且在洋馆展开了调查行动。阿尔法小队中的克里斯和吉尔知道了威斯克的阴谋，威斯克释放出了暴君，并启动了自毁程序，但自己却被暴君所伤。众人被迫逃离，就在危机时刻，小队中的直升机驾驶员「布拉德」给了众人火箭筒，最后暴君被火箭筒炸死，最后活下来的只有克里斯、吉尔、瑞贝卡、巴瑞和布拉德。
被暴君所伤的威斯克因为注射了始祖病毒，使伤口愈合，随后他靠着与病毒完美融合后的能力，逃出了洋馆，但在此前，他遇到了谢尔盖，并与他的两个「伊万型暴君」决斗，并成功杀死了两个暴君，随后威斯克赶在洋馆爆炸前成功逃离。
克里斯回去后想要向媒体揭露真相，但保护伞公司已经派人将洋馆等地的犯罪痕迹抹除，否认掉克里斯的指证，并诬陷S.T.A.R.S.小队等人吸毒。克里斯，吉尔和巴瑞主动离开S.T.A.R.S.小队，巴瑞将瑞贝卡推荐到缅因州分部的「灯塔研究所」，而洋馆爆炸也被称为「洋馆事件」。
随后，克里斯前往欧洲继续调查安布雷拉，而巴瑞带着家人去到了加拿大，只有吉尔和布拉德留在了浣熊市。
瑞贝卡受缅因州S.T.A.R.S「埃克塞特支部」的「大卫·特拉普」邀请一同前往位于缅因州的小城镇「卡利班海湾」，那里有一处安布雷拉的研究设施。大卫的计划是从里面盗出安布雷拉进行生化实验的证据，然后将之公诸于众，瑞贝卡和大卫的同伴潜入后，遇到了一系列袭击，最终只有大卫和瑞贝卡带着证据活着逃离。
大西洋生物废弃处理厂的主管「墨菲斯」因一次失误导致十名人员伤亡，这让安布雷拉质疑了他的能力，而后在浣熊市事件后，墨菲斯被迫替安布雷拉背了锅，并被开除。
9月20日威廉与美国国防部联络。
9月21日，保护伞公司研究员威廉为了保护自己的杰作G病毒与保护伞公司的特种部队在保护伞公司地下研究所发生混战，混战中威廉身受重伤，G病毒被保护伞公司的特种部队抢走。威廉在临死前给自己注射了G病毒，复活后的威廉消灭了保护伞公司的特种部队，混战中T病毒和G病毒泄漏液体被老鼠吞食，保护伞公司的特种部队只有死神汉克幸存。被携带T病毒的老鼠污染了当地的自来水迅速感染了几乎所有的浣熊市的市民，造成「浣熊市生化危机事件」。
病毒外泄开始。受感染的老鼠开始传播病毒，剩下的病毒液也污染了水源，让此时城市北部的居民开始出现感染症状。
「迪伦·布莱克」和他最好的朋友「JJ」同其他安布雷拉士兵在疫情爆发初期前往浣熊市，但遇到丧尸袭击，最后除了迪伦，其他人都死了。
同日城市北部阿克雷综合医院内，最近因皮肤发痒、轻微的组织坏死和贪食等症状前来医院就医的人数越来越多。这些患者一部分是近期去过阿克雷山区度假的市民，另一部分则是在浣熊市公园工作的员工。
阿克雷综合医院已经接近饱和。院长立即向市长报告了医院出现的情况，并请求浣熊市综合医院的支持。
浣熊市内，「中国」国企—「神龙集团」培养的特工艾达·王坐在吧台，将一份文件交给了酒吧老板。最近一个月来，她接到神龙集团的激活信息，她将作为组织安插在保护伞公司的间谍，密切监视威廉的研究进度。
准备前往浣熊市警察局报道的新届警察「里昂·S·肯尼迪」接到通知，让他在家中待命，暂时不要前往浣熊市内。此时，浣熊市遭遇不明原因的生化袭击的消息已经在全美国疯传，尽管官方多次辟谣，但仍然不断有莫名怪物在浣熊市阿克雷山区袭击人类的报道。克莱尔为了确认自己的哥哥克里斯是否安全，决定只身前往浣熊市。
最终在当晚，所有在医院内的患者几乎同时“死亡”随后“复活”。漫长而可怕的一夜开始了。
浣熊市内的警察们对于他们面对的事件依然一无所知。当警方意识到事态异常而紧急控制自来水厂时，一切为时过晚，病毒早已泄露了。但此时市民还是没什么反应，只是开始流传“吃人病”、“邪教徒”、“疯子”这样的传言。
而被公司收买的「布莱恩·艾隆斯」局长则开始刻意妨碍警察镇压。并且反对向州政府求援，「马文」副局长趁乱向「史东微尔市」请求支援。为浣熊市争到了宝贵的“时间”。但他们的英勇献身只是使毁灭延缓了暂时。
威廉在自己的地下试验室中漫无目的地游荡。被G病毒感染之后，他已杀死了前来抢夺G病毒的U·S·S队员。T病毒和G病毒的混合物在激战中进入浣熊市的排水系统。全体浣熊市市民即将陪他一起走向死亡。现在，G病毒驱使他向其最好的宿主——他的女儿「雪莉」寄生病毒。
9月22日，因自来水受污染，警方紧急控制了全市的自来水。全城供水中断。但为时已晚城市北部已经感染大规模爆发已经沦陷，此时除了警方全城还不知道这是感染。美国中央收到了一份来自史东微尔的紧急通知，声称浣熊市爆发大规模不明病毒感染事件，此时超过一万名市民被感染已经开始超出了警方的控制范围，北部所有的警局与消防医疗设施遭到感染者攻击。
北部开始逐渐失去控制绝大多数避难所和撤离点均被丧尸所攻破，白宫内部开始分成两派，以亚当·本福特为中心认为应该立即利用军队救助浣熊市，以家族组织首领西蒙斯为中心应该要把浣熊市抛弃的一派，因为白宫内部意见不统一，同时因为安布雷拉与警局局长的妨碍，导致浣熊市警方错过了可以控制事态的最佳时机。同时在白宫争吵不休的时候，安布雷拉趁乱开始行动。
警察局之前关于让市民们在家里不要出门的指令并没有对抑制疫情扩散起到任何作用，因为整个浣熊市的饮用水已经完全被污染，被感染变成丧尸的市民纷纷撞破玻璃，直接从窗户滚落下来，然后加入到丧尸大军当中。
报警电话已经被彻底打爆，伤人者越来越多，已经呈蔓延的趋势，而警察局长艾隆斯却依然把自己锁在办公室不肯出来。更加要命的是，他还锁住了警察局的弹药库，这让很多警察只有手枪可以使用。这直接导致了北部警察弹药不足而导致沦陷。
「亚当·本福特」开始尽自己的一切可能支援浣熊市，包括调动全州的国民警卫队调往浣熊市，安布雷拉与西蒙斯则开始对军方施压企图对浣熊市进行“灭菌”。
9月23日，警局局长对所有执勤的警官下达禁止开枪的命令，但是美国政府对在电视与广播中对全城所有的警官下达可以开火以及使用重武器的命令，警方利用炸弹等武器在北部感染都较高的安纳达利街进行强攻镇压，其余警方开始疏散北部市民，此时除了少部分市民以外其他人员依然不知道这是感染事件，事态开始逐渐恶化，最终在下午警方放弃了感染都较高的北部地区，浣熊市被分成两半。
经过一连串的激战，浣熊市北部地区已经失守。在警察的疏导下，幸存的居民被安置在浣熊市南部。他们坚信放弃了浣熊市北部，凭借剩余的人手，可以完成浣熊市南部的保卫工作。
由101空突师、第4装甲步兵师以及州国民警卫队紧急组成的部队到达浣熊市。
军队的调动对RPD来说也许是个好消息。可是事实上，军队来了只将外围把浣熊市彻底封锁死，防止疫情蔓延出去。然后派了一些小部队进城来查看情况。浣熊市也基本上就是座“死”城了。
9月24日，事与愿违。病毒开始向南部扩散，在南部浣熊市体育场举行的美国足球大联盟的比赛中，突然爆发“暴动”，这也是浣熊市南部第一次发生大规模生化危机事件，比赛被迫中止，50名人员受伤警方被确认未被感染已经被送到浣熊市总部医院。
安布雷拉趁乱关闭浣熊市附近所有的通信基站，切断了市内一切通讯，包括有线电话交换器也全部切断。城市与外部彻底失联。
安布雷拉则开始对国民警卫队与州政府施压反对军方进城。同时通告国民警卫队，现在浣熊市已经爆发大规模疫情，让他们封锁城市周边，但是千万不要进城，由他们来负责，导致军方无法进城支援。同时安布雷拉公司准备毁灭一切证据。
9月25日，全城生化灾难全面爆发，病毒泄漏事件已经无法控制，当晚《每日浣熊》、《浣熊时报》等新闻媒体指责浣熊市政府和警方封锁消息。在得到市场办公室的授权后，当日警方公开声称这是一起病毒感染事件。
媒体开始指责之前浣熊市警察局瞒报事件真相。
此时病毒感染人数已经超过十万，警方已经无力控制局面，各大交通要道被堵塞或者破坏，导致城市逐渐被孤立。
此时的市长办公室内，市长迈克·沃伦和浣熊市内主要行政要员正通过电话向白宫报道浣熊市内所经历的一切，与保护伞公司有着密切联系的迈克·沃伦已经意识到发生了什么，但是他也清楚自己现在的一切都来自背后的金主保护伞公司。
白宫在接到浣熊市的汇报后，迅速开始安排拯救浣熊市的行动，国民警卫队已经待命相关计划已经开始评估实施。
在绝大多数的市民还不知道浣熊市发生了什么的时候，亚妮（威廉·柏金的妻子）已经预料到这场灾难的结果。在她得知丈夫变异之后，她就知道这场危机会在短时间内让浣熊市崩溃。她把女儿安置在浣熊市警察局内，在叮嘱女儿不要乱跑之后，她离开警察局去找丈夫，她依旧坚信，通过自己的努力能够将丈夫恢复原样。
9月28日当晚，吉尔此时被复仇女神计划的完成品—「追踪者（暴君-203型化学武器）」追杀，而布莱克也早已被感染，随后吉尔遇到安布雷拉公司的生化危机特别应变部队的「卡洛斯」，幸存人员还有「米克鲁」，安布雷拉的对策部队d小队队长，过去曾任克格勃组织的领导人—「尼克拉」，安布雷拉的对策部队d小队b分队的佣兵。
马文遇见了变异的布拉德，但因一时心软而疏忽，导致自己被咬。
吉尔在准备逃离浣熊市时，被追踪者追上，米克鲁牺牲，而尼克拉则抛弃了吉尔独自逃跑，随后吉尔在与追踪者决战时，被追踪者注入了T病毒，导致吉尔昏迷。
9月29日，卡洛斯找到了昏迷的吉尔，并将她带到医院，并利用疫苗拯救了吉尔，但也因此使吉尔体内出现了T病毒抗体。
当晚，里昂和为了寻找哥哥克里斯下落的克莱尔来到浣熊市，马文也在二人到来后没多久就变异了。
里昂和克莱尔先后到达浣熊市警察局，克莱尔在找到威廉的女儿雪莉后，带着她第一个到达停车场并遇到了局长艾隆斯，艾隆斯将雪莉带到了孤儿院，而克莱尔也随后赶往。
里昂来到警察局后，在去往停车场后遇到了艾达，之后二人在赶退了暴君后去往了地下安布雷拉研究所。
此时，艾隆斯被威廉注射G病毒而亡，赶来的克莱尔带着雪莉准备离开，不料遇到暴君，就在这时威廉赶来并杀死暴君，但此时的威廉变异为「G2形态」，三人一起随电梯掉入地下，随后雪莉被威廉注射G病毒。
在安布雷拉地下研究所内，里昂找到了艾达所要的G病毒样本，此时的克莱尔找到疫苗并打败了「G3形态—堕落天使」的威廉，雪莉康复但留下了一点病毒却不会对雪莉造成坏的影响，之后克莱尔和雪莉找到了地下列车并准备离开，亚妮则启动了自毁装置。
里昂通过亚妮得知了艾达的身份，而艾达则被亚妮开枪射中和G病毒样本一起坠入深渊，而亚妮则因为重伤而亡，随后里昂伤心离开，并得知克莱尔准备乘地下列车离开。
「G4形态」的威廉出现，但被克莱尔击败，而此时的里昂在得到了艾达给予的火箭筒后击败了解除封印的「超级暴君」并成功赶上离开的列车，就在这时，「G5形态」的威廉出现，里昂只得对抗威廉，克莱尔将威廉连同它所在的车厢一起放入火海中，最后三人安全逃脱。
10月初被污染地区包围而四面楚歌的浣熊市已无任何挽救的希望，病毒借助下水管道感染了其中的生物并借此进入城市。灾变很快以污染源所在的城区为中心向全城蔓延。市内紧急部署的军力在很短的时间内就逐渐瓦解。浣熊市渐渐沦为一座被病毒完全侵蚀的人间地狱。美国军方很快封锁了该片区域并投入大规模的军队控制事态进一步恶化。几天后进入浣熊市的美军在与生化怪物的战斗中遭受严重损失，最后在实验体销毁工厂消灭五只暴君之后匆忙撤退，国家高层紧急通过了「灭菌作战方案」。
谢尔盖在浣熊市即将被炸之前，取走了装有安布雷拉最高机密的「U.M.F-013」。
数小时后，军方投放了一枚核弹，浣熊市于凌晨从地球上彻底抹去，超过10万人在此次灾变中死亡，而吉尔和卡洛斯在爆炸之前成功逃跑，并杀死了追踪者，另外，U.S.S还有最后的生还者—汉克，他带着G病毒样本成功逃离，之后他被队友们称为「死神」。
尼克拉被吉尔和卡洛斯抛弃后，生死未卜。
艾达选择投靠威斯克，并在让威斯克得到G病毒后，与威斯克一起逃出浣熊市。
整个事件公开后，美国政府颁布了一条法令，无限期禁止安布雷拉的一切商业活动。
在浣熊市事件后，西蒙斯心生一种去研发更强力病毒的想法，在此期间他招募了一个已经成为女研究员的卡拉。
安布雷拉利用T病毒与汉克带来的唯一一份G病毒样本两者相融合，「T＋G病毒」诞生。
10月9日席那岛监狱的年轻囚犯计划集体越狱。
10月10日席那岛监狱发生囚犯企图夺枪集体越狱事件，席那岛司令官「宾赛德」下令将逃犯全数射杀。
10月11日宾赛德命令席那岛监狱长，将囚犯就地全数处决，以“集体自杀”的方式向保护伞公司高层汇报。
10月中旬美国中央情报局和里昂取得联系，以雪莉与里昂的性命作要胁，迫使里昂接受了情报局所交付的秘密任务。里昂暂时待在CIA工作并进行调查，但是CIA是否有其它目的并不明朗。
11月初接受好友里昂的委托，「亚克」潜入安布雷拉席那岛监狱进行调查。
11月22日宾赛德将T病毒散播到席那岛的街道上，并且伪装成发生意外事故。
11月23日席那岛全岛已经笼罩在T病毒所引起的生化危机之下。
11月24日亚克企图从席那岛逃离时，搭乘的直升机被安布雷拉职员击落，因为强烈冲击而丧失记忆。在寻找恢复记忆的线索与逃生方法时，遇到席那岛上的生化灾害幸存者—年仅十二岁的少年「洛特·克莱恩」与洛特的妹妹—「莉莉·克莱恩」。
11月25日宾赛德唤醒「睡神暴君」企图将亚克灭口，却反被睡神暴君所杀。亚克成功地将睡神暴君打倒，带着洛特与莉莉从席那岛逃出，席那岛上的研究设施也因为宾赛德启动自爆装置而全数毁灭。
12月12日，为了寻找克里斯而侵入安布雷拉「巴黎研究所」的克莱尔遭到逮捕并送往位于南太平洋的洛克福特岛军事训练所监禁。
12月27日谜之组织「H.C.F」得知阿莱克茜亚和维罗妮卡病毒出现在洛克福德岛，命令阿尔伯特·威斯克率领特殊部队前往夺取。
威斯克在轰炸过程中造成病毒泄漏。克莱尔借机逃出监狱，并与年轻犯人史蒂夫相遇。
阿尔弗雷德与克莱尔发生激战并激活了洛克福德岛的自毁系统，克莱尔和史蒂夫搭乘飞机逃离里洛克福德岛，然而阿尔弗雷德操纵飞机飞往南极基地。
两人在南极基地射伤了阿尔弗雷德，垂死之际，阿尔弗雷德唤醒了沉睡的阿莱克茜亚后死亡。
克里斯收到里昂的信息后为救克莱尔也前往洛克福德岛，却遇到了本以为早已死亡的威斯克。
威斯克找到阿莱克茜亚并向她讨要维罗尼卡病毒。阿莱克茜亚和威斯克一交手便打跑了威斯克。
克里斯和克莱尔即将逃离南极基地之际阿莱克茜亚追至，通过一番艰难的对决，克里斯最终借助这一区域的高能武器消灭了阿莱克茜亚并引爆了南极基地。威斯克则在此之前回收了史蒂夫身上感染的维罗妮卡病毒。
克莱尔从南极安布雷拉实验室逃离后，加入了「大地救援部」。
1999年
克劳萨加入由美国总统直接统率的「最高机密组织」，同时担任里昂的教官。